工程款项应该记的科目有以下几种：
一般应付款项
工程款通常由客户先支付给供应商，供应商在完成工程后再把款项收取回来。因此，在会计处理时，应将工程款作为一般应付款项记入会计科目，如财产、厂房和设备。在出现支出时，应先抵消相应的应付款项，再出现应收账款时，应先抵消相应的应付款项，以免产生重复记账。
应收账款
如果工程款是一般应收账款，可先抵消相应的应付款项并确认工程款，随后在收取客户款项时再转到应收款项中，这样可以避免重复记账的问题，从而保证账务准确性。
应付账款
根据会计准则，工程款应计入“建筑物”或“机器设备”会计科目中，或者是这些科目的相关子科目中。在这一步，我们需要在“应付账款”会计科目中，建立“工程款”子科目，并将应付款项，按照支出费用和折旧支出费用来记账。
其他应收款
工程款也可以包括在“其他应收款”会计科目中，对应应收款子科目一般分为“预付账款”“工程款”等。如果是以往的投资，可以考虑计入“可供出售金融资产”科目。
建筑工程成本或机械设备支出
支付工程款时，根据支付的内容来判断贷方的科目，比如针对的是建筑工程的支出，则贷方科目为建筑工程成本，如果是机械设备的支出，贷方科目则为机械设备支出。
在建工程
工程款支付的款项包括工程预付款、工程进度款、工程结算款、工程费用、工程质量保修金及设备质量保修金等。支付工程款项，应记入工程成本，与工程款均通过在建工程科目核算，完工后转入固定资产。
固定资产
对厂房工程，应记入工程成本，与工程款均通过在建工程科目核算，完工后转入固定资产。从会计的角度划分，固定资产一般被分为生产用固定资产、非生产用固定资产、租出固定资产、未使用固定资产、不需用固定资产、融资租赁固定资产、接受捐赠固定资产等。
工程施工
工程施工科目的应用，支付给承包商的工程款项通常会根据工程的性质和进度来决定计入哪个科目。如果是正在进行中的工程项目，那么这笔款项可能会被计入“工程施工”科目；如果工程尚未开始或者已经完工，但尚未达到可使用状态，那么可能需要计入“在建工程”科目。
综上所述，工程款项的会计处理应根据具体的业务性质和会计准则来选择合适的科目，以确保账务的准确性和合规性。
